《尘埃与多世界编年史》
尘埃、达埃蒙与权威者的旧秩序
尘埃先于人类的帝国、教会和学院流动在多世界之间。它依附于有意识的生命，在孩子身旁稀薄，在成人身上沉积，在思想、经验和选择中显出形迹。莱拉所在的世界里，每个人的灵魂以达埃蒙的形态行走在身体之外；儿童的达埃蒙不断变形，成年后固定成一种动物，这让成长本身成为可见的界线，也让尘埃最先被那些惧怕成熟与自由的权力者盯上。
第一位从尘埃中显现的天使自称权威者。他把自己置于万物之上，向后来的天使和无数世界宣告自己创造了一切。这个谎言在漫长时间中变成制度，天堂的王国在天使秩序中成形，人的世界则由教会把持解释权。教会不只管理信仰，也管理知识、仪器、异端、远行和儿童，它把尘埃称为堕落的痕迹，把成年时达埃蒙固定的变化视作需要审判和控制的入口。
权威者逐渐衰弱后，摄政天使梅塔特隆承接了更锋利的统治。他曾是人，升入天使层级后获得巨大的权力，也继承了对服从的欲望。教会在人间的机构与天堂秩序互相呼应，学者、神职人员、审判者和秘密委员会都在寻找尘埃的性质。多世界由无数看不见的边界隔开，普通人只在自己的天空下生活，直到几个人的野心、恐惧和爱把这些边界接连割开。
约旦学院与北方裂口的开端
莱拉·贝拉夸在牛津约旦学院的屋顶、地窖和餐厅之间长大。她和达埃蒙潘特莱蒙把学院当成自己的领地，与仆人、学者和城里的孩子周旋，却不知道自己的身世已经被成人的战争包围。阿斯瑞尔勋爵来到学院时，带回北方的照片和实验痕迹：极光下出现了另一个城市，尘埃在成人身上聚集，儿童身上却显得不同。学院的密室里，莱拉偷听到这些线索，也第一次看见自己的世界外还有别的世界影子。
阿斯瑞尔想证明尘埃与平行世界真实存在。他需要资金、仪器和进入北方的自由，教会则担心他的发现撕开旧秩序。学院院长试图毒杀他，莱拉从藏身处冲出，阻止酒杯送到阿斯瑞尔手里。这个选择把她从学院孩子的恶作剧生活推向更大的轨道：她救下父亲，却不知道这个父亲日后会用另一个孩子完成跨世界的裂口。
城中儿童接连失踪，孩子们把掳人者叫作“吞食者”。莱拉的朋友罗杰被带走后，恐惧落到她熟悉的街巷。教会下属的奉献委员会暗中抓捕儿童，把他们送往北方，用切断孩子与达埃蒙联系的实验研究尘埃。对教会而言，切割达埃蒙可以让儿童在成年前脱离尘埃的沉积；对被抓走的孩子而言，那是灵魂被撕离身体的寒冷痛苦。
库尔特夫人、真理仪和逃离伦敦
玛丽莎·库尔特夫人把莱拉从约旦学院带到伦敦。她优雅、聪明，能够操纵房间里每一场谈话，也能让自己的金猴达埃蒙在暗处搜查和威胁。莱拉最初被新衣服、社交场和远行承诺吸引，但她很快发现库尔特夫人与奉献委员会相连，失踪儿童的路线通向她的权力网络。潘特莱蒙感到金猴靠近时的恐惧，莱拉也从书桌、抽屉和谈话缝隙里看见了温柔外表下的控制。
约旦学院院长曾把真理仪交给莱拉。那只金色仪器布满符号，指针会在问题中转动，成人需要多年训练才能解读，莱拉却能凭直觉进入它的含义。她在库尔特夫人的屋中用真理仪寻找罗杰和北方孩子的下落，仪器把她引向隐藏的危险，也让她明白自己不能再留在伦敦。她带着潘特莱蒙逃出库尔特夫人的社交网，进入吉普赛人的保护之中。
吉普赛人同样失去了孩子，他们把家庭船只和氏族力量集中起来，准备向北方追索。法德尔·科拉姆、约翰·法阿和其他长者听莱拉解读真理仪，也把她带入成人的救援行动。女巫塞拉菲娜·佩卡拉从天空送来帮助，热气球飞行员李·斯科斯比加入远行，装甲熊约雷克·伯尼森则从被欺骗和流放的低谷中取回自己的甲胄。莱拉在一连串联盟中学会使用谎言、勇气和真理仪，她的行动开始改变北方各族的力量分布。
博尔文加、装甲熊与第一次解放
北方的寒冷把奉献委员会的实验藏在博尔文加。被掳来的儿童被安置在干净房间里，等待与达埃蒙分离。莱拉混入设施后，看见那些被切割过的孩子像失去热源的躯壳一样坐着，他们仍能呼吸，却无法完整回应世界。她找到罗杰，也看见机器如何把儿童和达埃蒙拉向两端。库尔特夫人赶到实验室时，莱拉差点被放上切割机器，母女关系在机器的嗡鸣和潘特莱蒙的挣扎中暴露出真正的残酷。
莱拉在孩子们中制造混乱，把厨房、睡房和通道变成逃生路线。吉普赛人、女巫和约雷克从外部发动攻击，博尔文加的守卫和研究者失去控制，孩子们带着达埃蒙冲出冰原。被切割的孩子仍留下无法弥补的创伤，奉献委员会的实验却在这一夜被撕开外壳。教会第一次失去对尘埃研究的隐秘优势，也意识到莱拉已经成为无法忽视的敌人。
莱拉随后被带往斯瓦尔巴，进入装甲熊王国的权力争斗。伪王约弗尔想模仿人类，渴望达埃蒙和贵族仪式，约雷克则被夺走甲胄和王位后长期流亡。莱拉利用约弗尔的虚荣，诱使他与约雷克决斗。冰原上的熊王战斗不靠人类誓言，只凭力量、甲胄和判断，约雷克在搏杀中杀死约弗尔，重新成为熊王。莱拉因此赢得装甲熊的支持，也抵达了阿斯瑞尔被囚禁的北方堡垒。
阿斯瑞尔的桥与罗杰之死
阿斯瑞尔在北方等待莱拉带来完成实验的最后条件。他已经确认尘埃、达埃蒙和世界之间的通道存在联系，也知道巨大能量可以撕开天空。他需要一个孩子和达埃蒙分离时释放的力量。莱拉带着罗杰来到他面前，以为自己把朋友送到了安全处，却在父亲的眼神和行动中发现另一种危险。阿斯瑞尔把罗杰带走，莱拉在雪地和裂谷之间追赶，却无法阻止机器启动。
罗杰与达埃蒙被强行分离，痛苦释放出足以劈开极光的能量。天空里的城市不再只是照片中的影像，阿斯瑞尔跨过裂口，走向另一个世界，准备与权威者和梅塔特隆开战。罗杰死在莱拉身边，莱拉的背叛并非出于恶意，却由她亲手把朋友带到阿斯瑞尔面前完成。这个死亡成为多世界战争的真正开端，也让莱拉第一次明白成人的宏大目标可以踩碎一个孩子的生命。
莱拉没有回到学院，也没有留在北方等待教会追捕。她带着潘特莱蒙穿过阿斯瑞尔打开的桥，进入未知世界。身后的世界已经无法恢复原状：教会失去了部分秘密，阿斯瑞尔拥有通往多世界的道路，库尔特夫人开始在权力和母爱之间摇摆，罗杰的死亡则在莱拉心中留下无法绕开的债。她的远行从寻找朋友变成追问尘埃、死亡和自由的道路。
奇塔加泽、威尔与微妙刀
另一个世界的英国中，威尔·帕里长期照顾精神失衡的母亲，学会躲开陌生人的视线和追问。有人闯入家中寻找他父亲约翰·帕里的文件，威尔在搏斗中使入侵者坠亡，被迫逃离。他穿过一扇窗口来到奇塔加泽，一座被幽灵占据的城市。这里的孩子在街头生存，成年人一旦进入就会被幽灵吸食意识，只剩空壳。世界之间的窗口曾让奇塔加泽繁盛，也让灾难在城市中扎根。
莱拉在奇塔加泽遇见威尔。两人最初互相试探，潘特莱蒙对这个没有外显达埃蒙的男孩保持戒备，威尔则把莱拉的仪器和谎言都看作危险。真理仪指向威尔父亲的线索，也把他们带回威尔所在的牛津。莱拉找到物理学家玛丽·马隆，向她展示尘埃的存在；玛丽用计算机与被她称作暗物质的意识粒子接触，收到离开自己世界的指令。与此同时，博雷尔勋爵夺走真理仪，把莱拉重新拖入成人势力的交易。
威尔为了取回真理仪进入奇塔加泽的刀塔，与老持刀者贾科莫·帕拉迪西相遇。微妙刀能割开任何物质，也能在世界之间划出窗口。威尔在争夺中失去两根手指，成为新持刀者。刀让他拥有穿越世界的能力，也把责任压到他手中：每一次开窗若不关闭，尘埃都会流失，幽灵也会诞生。莱拉拥有真理仪，威尔拥有刀，两件工具把他们从逃亡的孩子变成多世界裂口的关键行动者。
天使、父子相认与战争集结
阿斯瑞尔在群山与要塞之间集结反抗天堂的军队。他召集女巫、叛逆天使、不同世界的战士和被教会压制的力量，想建立“天堂共和国”，用战争推翻权威者的谎言和梅塔特隆的统治。教会则把莱拉视为古老预言中的关键女孩，担心她重复某个会改变尘埃流向的选择，于是派出神职机构、刺客和军队追索她。多世界的冲突从学院会议和北方实验扩散到每一条窗口和每一处边境。
威尔被天使巴尔萨莫斯和巴鲁克引向阿斯瑞尔阵营，却坚持先寻找父亲。李·斯科斯比也为寻找约翰·帕里深入危险地带，在追兵围困中用气球和枪为讯息争取时间。约翰·帕里以斯坦尼斯劳斯·格鲁曼的身份行走在莱拉世界，成为萨满后理解了刀、窗口和世界失衡。他与威尔终于在山间相认，却只来得及把持刀者必须前往阿斯瑞尔或完成使命的重担交给儿子。父子短暂拥抱后，约翰被杀，威尔刚得到父亲就再次失去他。
库尔特夫人先把莱拉带走，藏在洞穴中，用药让她沉睡。她保护女儿免受教会刺杀，也把莱拉囚禁在自己的控制里。威尔与两名加利维斯平间谍提亚利斯和萨尔马奇亚追到洞穴，库尔特夫人的联盟不断变化：她骗过教会，试图骗过阿斯瑞尔，也在女儿面前逐渐失去纯粹操控的姿态。威尔救出莱拉后，莱拉说出梦中罗杰在死者世界呼唤她。她决定暂缓投向阿斯瑞尔的战争，先去寻找被囚禁的死者。
死者世界、达埃蒙分离与亡魂出逃
死者世界没有阳光、树木和真正的安息，亡魂被鹰身女妖看守，在灰暗旷野中保留记忆与悔恨。活人无法带着达埃蒙进入那里，莱拉和威尔来到渡口时，潘特莱蒙和威尔尚未显形的达埃蒙都被迫留在外面。莱拉与潘特莱蒙的分离没有经过实验机器，却同样让彼此感到撕裂。她为了兑现对罗杰的债走进死者世界，潘特莱蒙因此承受被抛下的痛苦，这个伤口后来改变了他们之间的信任。
莱拉在死者中找到罗杰，也遇见许多被死亡拘束的灵魂。她原先想把罗杰带回生命，却在灰暗世界里明白死者真正需要离开囚笼。威尔用微妙刀割开通向外部世界的出口，亡魂穿过窗口时接触到真实空气，身体化作粒子回到宇宙。鹰身女妖曾以羞辱死者为乐，听见莱拉和威尔愿意带来真实故事后，开始接受新的职责：引导死者走向出口，让他们以自己的经历换取自由。
这一行动改变了死亡秩序。死者世界不再是永恒监牢，罗杰也终于脱离等待和孤独。莱拉没有抹去自己害死朋友的后果，她用进入死者世界和释放亡魂来偿还那场背叛。威尔的刀第一次越过制造危险窗口的用途，成为打开囚禁制度的工具。与此同时，刀造成的伤口仍在世界之间消耗尘埃，孩子们救出亡魂的选择把终局问题推到眼前：若窗口继续存在，生命意识赖以成长的尘埃会不断流失。
玛丽·马隆、穆勒法与尘埃流向
玛丽·马隆离开自己的牛津后，来到有穆勒法生活的世界。那里的草原、轮树和种子构成另一种文明基础，穆勒法以种荚为轮，与道路和树木形成长期共生。玛丽学习他们的语言，观察他们如何在没有人类城市和教会的条件下理解世界。她用琥珀色树脂制成观察仪器，看见尘埃像光流一样穿过空气，也看见尘埃正被无形缺口抽走。
穆勒法的世界让玛丽明白，尘埃依赖有意识生命的经验、感官和理解，也滋养这些生命继续成长。若窗口大量敞开，尘埃从世界中流失，穆勒法赖以维持道路和树木循环的生态将逐渐衰败，人类世界中的意识也会受损。她的发现把尘埃从教会恐惧的“堕落痕迹”中解放出来，使它显现为生命成熟、认识和相爱的结果。她没有军队，也没有神职权威，却在草原上的观察中抓住了多世界存亡的物质原因。
莱拉和威尔从死者世界出来后抵达穆勒法的世界。两人重新寻找各自的达埃蒙，也面对潘特莱蒙与莱拉之间的裂痕。玛丽在他们身边讲述自己的往事，让莱拉和威尔第一次把彼此的感情看清。这个讲述像一次温和的引导，让他们从使命、逃亡和战争中落回身体与心灵的经验。尘埃开始向他们聚集，他们的相爱使世界的流向出现变化，也让教会一直恐惧的预言落到具体的人身上。
深渊、权威者之死与梅塔特隆坠落
阿斯瑞尔的战争在多世界边境爆发。天使、女巫、加利维斯平、装甲熊和人类战士进入混战，教会军队和天堂势力试图夺回莱拉与威尔。战场的关键不只在兵力，也在深渊：那里张开于世界之间，能够吞没天使和灵魂般的存在。阿斯瑞尔把自己的反叛押在这个裂口上，准备把梅塔特隆拖入无法返回的坠落中。
库尔特夫人进入阿斯瑞尔阵营后，终于把自己的操控能力用在保护莱拉上。她接近梅塔特隆，利用他曾为人的欲望、傲慢和对她的轻视，把他引向阿斯瑞尔设下的深渊边缘。阿斯瑞尔与库尔特夫人在最后一刻共同抓住梅塔特隆，三者一起坠入深渊。阿斯瑞尔的反叛、库尔特夫人的母爱和梅塔特隆的统治欲在同一个行动中终结，莱拉的父母没有回到女儿身边，却用自己的毁灭切断了天堂摄政者的权力。
权威者被困在晶体囚笼中，由随从护送穿越战场。他已经衰弱到无法承受外部世界，莱拉和威尔打开囚笼时，并没有面对一位能继续统治万界的神，只看见一个脆弱、恐惧、几乎无声的古老天使。晶体破开后，权威者接触空气，身体随风消散。维持无数世界服从的最古老名义就此消失，权威者的谎言没有被另一座王座替代，多世界留下的是失去神圣中心后的自由与责任。
关闭窗口与天堂共和国的余生
战争结束后，莱拉和威尔必须处理刀留下的伤口。每一扇窗口都会消耗尘埃，每一次新的切割都会制造幽灵。若为了相守保留两人之间的通道，多世界会继续失血；若关闭窗口，他们只能回到各自出生的世界。天使解释，唯一必须保留的窗口是死者世界通向穆勒法世界的出口，因为死者需要从那里回归宇宙。其余窗口都要关闭，微妙刀也不能再被使用。
莱拉和威尔在穆勒法世界相爱，也在相爱后接受分离。他们知道彼此无法长期生活在对方世界，身体和达埃蒙都受本源世界约束。威尔折断微妙刀，切断继续开窗的诱惑，也终止刀制造幽灵的历史。两人约定每年同一日坐在各自牛津的同一处长椅上，虽被世界隔开，仍在想象中共享同一个时刻。这个约定没有改变物理边界，却让他们把失去转化成可以继续生活的秩序。
莱拉回到自己的牛津后，失去了凭直觉读取真理仪的能力。潘特莱蒙固定为松貂形态，他们之间经历过死者世界的伤口，仍要在余生中重新学习信任。玛丽回到自己的世界，学会看见自己的达埃蒙。威尔回到母亲身边，也带着基拉瓦稳定下来的形态继续成人生活。阿斯瑞尔的堡垒、库尔特夫人的阴谋、教会的追杀和天堂的王座都已崩塌，尘埃仍需要每个世界中的生命用经验、智慧、爱和诚实来保存。所谓天堂共和国没有落成在一座天上城市里，它停在莱拉和威尔分离后的世界状态中：权威者消散，梅塔特隆坠入深渊，死者获得出口，窗口被关闭，活着的人必须在自己的世界里建造值得尘埃停留的生活。