《重启的被选召孩子编年史》
东京网络危机与最初的奥米加兽
2020 年夏天，东京的网络突然失控。交通系统、金融数据、通讯线路和城市基础设施同时出现异常，现实世界的人只看见电子设备连锁故障，却不知道混乱的源头已经穿过网络深处，连接到另一个由数据构成的世界。八神太一在涩谷附近追赶即将失控的电车时，被卷入网络空间，在那里遇见亚古兽，也第一次看见阿戈兽群把现实世界的危机推向爆炸边缘。
太一没有时间理解数码世界的全貌。他和亚古兽被迫在高速流动的数据通道中战斗，亚古兽进化为暴龙兽，又在不断升级的敌人面前继续突破。泉光子郎在现实世界用电脑追踪异常，石田大和与加布兽从另一侧进入战场，三名孩子和两只搭档数码兽在导弹即将落向东京之前完成第一次合流。战斗暴龙兽与钢铁加鲁鲁尚未真正以各自的形态站稳历史位置，太一和大和的意志已经把两股力量推向合体，奥米加兽在网络战场中现身，刺穿阿戈兽造成的毁灭节点，把东京从第一场灾难里拉了回来。
这次胜利没有关闭通道。现实世界的孩子们只以为网络故障结束，太一、光子郎和大和却知道另一个世界正在向他们发出更深的召唤。阿戈兽留下的危机像一次警告：数码世界的战争可以直接牵动现实世界，现实世界的混乱也能反过来成为黑暗力量需要的数据。最初的奥米加兽没有给孩子们带来答案，只把他们推向一条更大的历史。
云之大陆与被选召的孩子集结
夏令营前后，新的异常把太一、武之内空、太刀川美美、城户丈、光子郎和大和卷入数码世界。这个世界不再只是网络空间里的短暂战场，而是一片有大陆、森林、河流、古代遗迹和族群秩序的广阔领域。孩子们在云之大陆醒来，分别遇见亚古兽、比丘兽、巴鲁兽、哥玛兽、甲虫兽和加布兽，被数码器承认为被选召的孩子。回家的路被切断，现实世界的危机仍然会随着数码世界的战况起伏，他们只能一边求生，一边寻找这场召唤的意义。
云之大陆已经被黑暗军团侵蚀。音鸟兽在天空中传播黑暗信号，把原本中立或善良的数码兽扭曲成军队，古代战争的残影在遗迹中不断浮现。太一和亚古兽在森林、峡谷和要塞之间开路，空与比丘兽在保护同伴时学会把飞行和牺牲绑在一起，美美与巴鲁兽从被迫劳动的数码兽那里看见黑暗军团对普通世界的压榨，丈和哥玛兽在逃亡与救援中承担起年长者的责任，光子郎和甲虫兽则用知识把混乱的地形、信号和敌人行动逐渐整理成可追踪的线索。
孩子们最初只想返回现实世界，却在一次次救援中发现数码世界有自己的受难者。被操控的数码兽、被占领的村落、被污染的水域和被封锁的遗迹，让他们明白这场旅行不只是个人脱险。黑暗军团寻找两位神圣数码兽，试图阻止古代战争中曾经守护世界的光重新出现。被选召的孩子因此从迷路者变成了战线的一部分，他们的每一次进化都不再只是力量增长，而是在数码世界内部夺回一块被压制的秩序。
恶魔兽、黑暗军团与神圣数码兽的呼唤
恶魔兽在黑暗军团中推动第一阶段的战争。他利用音鸟兽、眼兽和被污染的强敌切割孩子们的路线，把太一、大和和同伴们不断拖入分散战斗。太一习惯直接冲向最危险的地方，大和则更在意先确保同伴和弟弟的安全，两人的判断在多次战斗中碰撞。亚古兽和加布兽的力量越走越远，机械暴龙兽与兽人加鲁鲁兽先后站上战场，但黑暗军团也把敌人提升到更接近古代灾厄的层级。
高石岳被召唤进入数码世界后，战争的重心发生变化。巴达兽被黑暗力量追捕，他体内沉睡着神圣数码兽的可能性，恶魔兽试图在这股光彻底苏醒前将其污染。太一和大和在恶魔兽的城堡中迎来正面冲突，敌人的力量从恶魔兽膨胀为但丁恶魔兽，压迫孩子们的阵线。岳在恐惧中仍然伸手靠近巴达兽，巴达兽回应他的信任，天使兽的光在黑暗城堡中爆发，撕开恶魔兽支配战场的核心。
恶魔兽的倒下没有终结黑暗军团，只暴露出更深的灾难结构。神圣数码兽并非单独存在，八神光也被数码世界的声音呼唤。现实世界的妹妹被卷入时，太一的冒险从拯救陌生世界变成保护亲人的行动。骷髅骑士兽带着黑暗使命接近光，黑暗骑士兽试图把光的感应与古代灾厄连接起来。岳和光的加入，让队伍不再只是六名孩子寻找归途，而是八名孩子共同承担神圣数码兽、徽章和古代战争遗产的命运。
新大陆、黑暗骑士兽与千年兽复活
孩子们离开云之大陆后，新的大陆把战争推向更深处。这里散落着古代战争的痕迹，黑暗军团不再只靠占领和追杀推进，而是围绕千年兽的复活布置仪式。黑暗骑士兽掳走光，把她带向仪式中心，月千年兽的残片成为灾厄复苏的核心。太一追赶妹妹，大和与岳在另一侧对抗黑暗力量，其他孩子则在分散战斗中保护被波及的数码兽群落。
光与迪路兽的相遇改变了仪式走向。迪路兽曾在黑暗骑士兽的壳中被束缚，她与光的连接让被压制的神圣力量重新找到出口。光没有像普通人质一样等待救援，她以自己的感应靠近受困的灵魂，让迪路兽从黑暗骑士兽的结构中脱离。黑暗骑士兽的崩解使神圣阵营补全，天女兽的光与天使兽的力量遥相呼应，黑暗军团争夺神圣数码兽的计划失去最关键的束缚。
千年兽仍然完成复活。它以古代战争留下的毁灭意志压迫大陆，庞大的身躯和力量让孩子们此前的胜利显得渺小。太一和亚古兽在正面战场承受最直接的冲击，大和和加布兽从侧面寻找破口，其他孩子用各自的完全体力量拖住敌人的余波。战斗暴龙兽在这场灾厄前完成决定性突破，他不是单靠力量压倒千年兽，而是在同伴支撑出的缝隙里接近核心，以龙兽克星撕开敌人的要害。千年兽的崩坏让古代灾厄第一次被孩子们真正击退，也让他们看见黑暗军团背后还有更冷、更空洞的意志。
徽章之谜与孩子们各自的完全觉醒
千年兽倒下后，数码器中的徽章意义浮现。勇气、友情、爱心、知识、纯真、诚实、希望和光明不再只是孩子性格的标记，而是连接搭档进化、古代战争和世界修复的钥匙。孩子们必须离开单一战场，在数码世界各处经历独立的考验，才能让徽章从图案变成真正的力量。太一仍然承担最危险的正面冲锋，但这段历史开始把每个孩子都推到自己的选择面前。
空在天空与废墟之间保护弱小数码兽，她的爱心不是温柔停留在口头，而是在敌人攻击下选择把自己置于最前方，比丘兽因此走向凤凰兽。美美在矿区、城镇和被压迫的群体中坚持尊严，她拒绝把弱者当作战争损耗，巴鲁兽回应她的纯真与固执，蔷薇兽在战场上绽放。丈一次次被恐惧和责任拉扯，仍然在关键时刻保护同伴和陌生数码兽，哥玛兽进化为维京兽，把诚实从自我怀疑中拉成可以挡住敌人的盾。
光子郎在信息洪流中寻找真相。他面对的敌人往往不是单一怪物，而是无法理解的结构、信号和陷阱；甲虫兽最终进化为赫拉克勒独角仙兽，把知识转化为打开局面的力量。大和在孤独和友情之间反复选择，他不再只用冷静保护别人，也学会把自己的脆弱交给同伴，加布兽走向钢铁加鲁鲁。岳和光的力量则承担神圣侧的支柱，巴达兽与迪路兽分别通向炽天使兽和座天使兽，使古代战争中守护世界的光在新的孩子身上重新成形。
阿戈兽再临、古代黑暗与负兽的真相
徽章觉醒并未让危机结束。阿戈兽再次出现，这一次它不只是东京危机中的网络敌人，而是更深黑暗意志派出的试炼。太一和亚古兽被迫单独面对人形阿戈兽，对方不是单纯追求破坏，而是试探他们之间的连接是否足以承受最终灾厄。太一在战斗中看见自己的勇气会被敌人利用为鲁莽，亚古兽也必须在搭档几乎被吞没时继续相信太一的选择。
黑暗军团残存的音鸟兽聚集成更巨大的威胁，过去看似分散的污染、操控和毁灭信号开始被整理成同一条线。孩子们发现，千年兽并非灾厄的最初源头，阿戈兽、眼兽以及黑暗军团收集现实世界与数码世界数据的行动，都指向负兽。负兽像被程序和怨念推至极限的空洞，它从战争、恐惧和数据崩坏中成长，目标不是统治某片大陆，而是把一切归入大灾厄的白色虚无。
这一真相改变了战争性质。恶魔兽要污染神圣力量，千年兽要复活古代毁灭，负兽则要让两个世界失去存在的形状。孩子们已经拥有究极体力量，却必须学会让奥米加兽不再只是危急时偶然降临的奇迹。太一和大和的搭档曾经在东京危机中合体，但最终战需要所有徽章、所有搭档和两个世界的希望共同支撑。奥米加兽必须被孩子们主动召唤，才能成为对抗大灾厄的核心力量。
大灾厄、阿巴多兽与最终战
负兽发动大灾厄时，数码世界被白色虚无吞噬，现实世界也被连锁异常拖向崩坏。孩子们在阿戈兽群与负兽的压迫中被逼入最终战，究极体数码兽接连迎击，却无法阻止敌人继续进化。负兽转化为阿巴多兽，巨大的黑白球体和触手像一片吞噬世界的空洞，把孩子们和搭档的实体撕碎，许多力量被迫退回更弱的形态。战场不再有清晰的地面和天空，只剩两个世界被删除前的边缘。
希望从现实世界传来。曾经被网络危机波及的人们、与孩子们有过连接的人们，以及无数孩子的愿望，在虚无中形成光。被抹去实体的孩子们重新获得形体，搭档们再次进化，凤凰兽、蔷薇兽、维京兽、赫拉克勒独角仙兽、炽天使兽和座天使兽从外围牵制阿巴多兽，把敌人的行动拖慢。太一和大和把所有人的力量接到战斗暴龙兽与钢铁加鲁鲁身上，奥米加兽再次诞生，冲入阿巴多兽内部，直面核心。
阿巴多兽核心在内部战场中专门压制奥米加兽。它躲开正面突刺，用变形身体困住敌人，以眼球和触手构成的防御抵消炮击和剑击。外部的孩子们看见阿巴多兽行动滞后，立刻让各自的究极体继续攻击外壳，逼迫核心分散资源。奥米加兽在这场互相牵制中获得新的形态，转为奥米加兽 Alter-S，以更快的斩击和炮火突破核心防御。负兽的毁灭意志被切开，阿巴多兽收缩成数码蛋，白色虚无随之崩解，两个世界从大灾厄中恢复。
战后边界与继续开启的通道
阿巴多兽被击败后，数码世界的天空重新打开。曾经被黑暗军团压迫的村落、旅途中被孩子们救下的数码兽、在战争中短暂相伴又分离的朋友，都在不同地方迎来战后时刻。黑暗力量留下的创伤没有立刻消失，但数码世界不再被古代灾厄和负兽的虚无拖向毁灭。孩子们完成了从误入者到守护者的变化，他们不只是击败敌人，也让两个世界重新拥有交流的可能。
被选召的孩子返回现实世界时，搭档数码兽并没有像过去的传说那样彻底消失。亚古兽、加布兽、比丘兽、甲虫兽、巴鲁兽、哥玛兽、巴达兽和迪路兽以秘密伙伴的方式留在孩子身边，现实世界因此不再是与数码世界隔绝的普通城市。光子郎和美美继续研究两界通道程序，试图让往返不再依赖灾难和偶然召唤。数码器从战时工具变成连接未来的钥匙，孩子们也开始把冒险带回日常。
太一选择继续留在数码世界，与亚古兽一起探索更远的地方。其他孩子回到各自生活，却已经无法把数码世界当作一场结束的梦。大和与加布兽、空与比丘兽、美美与巴鲁兽、丈与哥玛兽、光子郎与甲虫兽、岳与巴达兽、光与迪路兽，都带着战后的连接继续前行。数码世界的战争在阿巴多兽化为数码蛋的那一刻收束，两个世界的边界则在孩子们和搭档的选择中保持开启。